Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1CQ13936 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1CQ13936 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1CQ13936 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1CQ13936 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1CQ13936 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1CQ13936 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1CQ13936 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1CQ13936 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1CQ13936 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1CQ13936 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1CQ13936 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1CQ13936 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1CQ13936 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA1CQ13936 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA1CQ13936 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA1CQ13936 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA1CQ13936 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1CQ13936 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1CQ13936 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1CQ13936 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1CQ13936 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1CQ13936 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1CQ13936 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1CQ13936 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1CQ13936 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1CQ13936 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1CQ13936 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1CQ13936 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1CQ13936 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1CQ13936 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1CQ13936 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1CQ13936 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1CQ13936 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1CQ13936 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1CQ13936 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1CQ13936 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1CQ13936 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1CQ13936 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1CQ13936 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1CQ13936 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1CQ13936 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1CQ13936 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1CQ13936 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1CQ13936 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1CQ13936 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1CQ13936 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1CQ13936 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1CQ13936 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1CQ13936 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1CQ13936 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1CQ13936 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1CQ13936 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1CQ13936 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1CQ13936 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1CQ13936 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1CQ13936 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1CQ13936 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1CQ13936 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1CQ13936 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1CQ13936 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1CQ13936 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1CQ13936 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1CQ13936 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1CQ13936 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1CQ13936 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1CQ13936 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1CQ13936 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1CQ13936 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1CQ13936 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1CQ13936 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1CQ13936 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1CQ13936 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1CQ13936 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1CQ13936 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1CQ13936 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1CQ13936 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1CQ13936 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1CQ13936 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1CQ13936 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1CQ13936 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1CQ13936 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1CQ13936 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1CQ13936 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1CQ13936 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1CQ13936 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1CQ13936 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1CQ13936 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1CQ13936 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1CQ13936 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1CQ13936 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1CQ13936 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1CQ13936 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1CQ13936 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1CQ13936 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1CQ13936 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1CQ13936 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1CQ13936 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1CQ13936 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1CQ13936 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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