Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MTMR3Q13615 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTMR3Q13615 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTMR3Q13615 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTMR3Q13615 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTMR3Q13615 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTMR3Q13615 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTMR3Q13615 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTMR3Q13615 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTMR3Q13615 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTMR3Q13615 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTMR3Q13615 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTMR3Q13615 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MTMR3Q13615 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTMR3Q13615 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTMR3Q13615 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MTMR3Q13615 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTMR3Q13615 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTMR3Q13615 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MTMR3Q13615 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTMR3Q13615 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTMR3Q13615 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTMR3Q13615 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTMR3Q13615 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTMR3Q13615 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTMR3Q13615 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTMR3Q13615 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTMR3Q13615 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTMR3Q13615 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTMR3Q13615 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTMR3Q13615 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTMR3Q13615 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTMR3Q13615 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTMR3Q13615 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTMR3Q13615 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTMR3Q13615 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTMR3Q13615 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTMR3Q13615 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTMR3Q13615 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTMR3Q13615 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTMR3Q13615 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MTMR3Q13615 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTMR3Q13615 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTMR3Q13615 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTMR3Q13615 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTMR3Q13615 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTMR3Q13615 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTMR3Q13615 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTMR3Q13615 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTMR3Q13615 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTMR3Q13615 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTMR3Q13615 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTMR3Q13615 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTMR3Q13615 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTMR3Q13615 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTMR3Q13615 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTMR3Q13615 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTMR3Q13615 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTMR3Q13615 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTMR3Q13615 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTMR3Q13615 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MTMR3Q13615 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTMR3Q13615 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTMR3Q13615 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTMR3Q13615 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTMR3Q13615 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTMR3Q13615 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTMR3Q13615 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTMR3Q13615 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MTMR3Q13615 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTMR3Q13615 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTMR3Q13615 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTMR3Q13615 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTMR3Q13615 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MTMR3Q13615 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTMR3Q13615 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTMR3Q13615 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MTMR3Q13615 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MTMR3Q13615 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MTMR3Q13615 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MTMR3Q13615 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MTMR3Q13615 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTMR3Q13615 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTMR3Q13615 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTMR3Q13615 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTMR3Q13615 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTMR3Q13615 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTMR3Q13615 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MTMR3Q13615 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTMR3Q13615 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTMR3Q13615 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTMR3Q13615 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTMR3Q13615 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTMR3Q13615 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTMR3Q13615 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTMR3Q13615 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTMR3Q13615 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTMR3Q13615 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTMR3Q13615 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MTMR3Q13615 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
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