Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSLNQ13421 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSLNQ13421 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSLNQ13421 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSLNQ13421 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSLNQ13421 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSLNQ13421 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MSLNQ13421 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSLNQ13421 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSLNQ13421 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSLNQ13421 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSLNQ13421 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSLNQ13421 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSLNQ13421 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSLNQ13421 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSLNQ13421 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSLNQ13421 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSLNQ13421 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSLNQ13421 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSLNQ13421 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSLNQ13421 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSLNQ13421 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSLNQ13421 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSLNQ13421 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSLNQ13421 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSLNQ13421 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSLNQ13421 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSLNQ13421 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSLNQ13421 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MSLNQ13421 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSLNQ13421 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSLNQ13421 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSLNQ13421 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSLNQ13421 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSLNQ13421 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSLNQ13421 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSLNQ13421 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSLNQ13421 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSLNQ13421 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSLNQ13421 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSLNQ13421 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
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