Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PSMD2Q13200 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PSMD2Q13200 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD2Q13200 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
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