Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK2Q13002 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK2Q13002 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK2Q13002 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK2Q13002 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK2Q13002 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK2Q13002 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK2Q13002 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIK2Q13002 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIK2Q13002 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIK2Q13002 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK2Q13002 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK2Q13002 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK2Q13002 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK2Q13002 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK2Q13002 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK2Q13002 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK2Q13002 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK2Q13002 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK2Q13002 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK2Q13002 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK2Q13002 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK2Q13002 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK2Q13002 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK2Q13002 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK2Q13002 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK2Q13002 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK2Q13002 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK2Q13002 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK2Q13002 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK2Q13002 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK2Q13002 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK2Q13002 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK2Q13002 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK2Q13002 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK2Q13002 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK2Q13002 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK2Q13002 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK2Q13002 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK2Q13002 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK2Q13002 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK2Q13002 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK2Q13002 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK2Q13002 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK2Q13002 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK2Q13002 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK2Q13002 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK2Q13002 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK2Q13002 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK2Q13002 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK2Q13002 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK2Q13002 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK2Q13002 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK2Q13002 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK2Q13002 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK2Q13002 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK2Q13002 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK2Q13002 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK2Q13002 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK2Q13002 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK2Q13002 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK2Q13002 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK2Q13002 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK2Q13002 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK2Q13002 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK2Q13002 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK2Q13002 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK2Q13002 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK2Q13002 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK2Q13002 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIK2Q13002 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIK2Q13002 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIK2Q13002 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIK2Q13002 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIK2Q13002 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIK2Q13002 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIK2Q13002 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIK2Q13002 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIK2Q13002 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIK2Q13002 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIK2Q13002 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIK2Q13002 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIK2Q13002 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIK2Q13002 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIK2Q13002 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIK2Q13002 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIK2Q13002 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIK2Q13002 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIK2Q13002 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIK2Q13002 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
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