Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCBP1Q09161 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCBP1Q09161 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCBP1Q09161 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCBP1Q09161 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCBP1Q09161 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCBP1Q09161 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCBP1Q09161 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCBP1Q09161 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCBP1Q09161 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCBP1Q09161 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCBP1Q09161 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCBP1Q09161 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCBP1Q09161 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCBP1Q09161 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCBP1Q09161 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCBP1Q09161 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NCBP1Q09161 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCBP1Q09161 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCBP1Q09161 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCBP1Q09161 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCBP1Q09161 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCBP1Q09161 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCBP1Q09161 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCBP1Q09161 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCBP1Q09161 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCBP1Q09161 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCBP1Q09161 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCBP1Q09161 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NCBP1Q09161 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCBP1Q09161 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCBP1Q09161 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCBP1Q09161 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCBP1Q09161 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCBP1Q09161 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCBP1Q09161 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NCBP1Q09161 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NCBP1Q09161 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NCBP1Q09161 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NCBP1Q09161 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NCBP1Q09161 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCBP1Q09161 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCBP1Q09161 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCBP1Q09161 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NCBP1Q09161 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCBP1Q09161 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCBP1Q09161 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCBP1Q09161 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCBP1Q09161 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCBP1Q09161 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NCBP1Q09161 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NCBP1Q09161 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NCBP1Q09161 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCBP1Q09161 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCBP1Q09161 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCBP1Q09161 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCBP1Q09161 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCBP1Q09161 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCBP1Q09161 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCBP1Q09161 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCBP1Q09161 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCBP1Q09161 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCBP1Q09161 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCBP1Q09161 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCBP1Q09161 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCBP1Q09161 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCBP1Q09161 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCBP1Q09161 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCBP1Q09161 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCBP1Q09161 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCBP1Q09161 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCBP1Q09161 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCBP1Q09161 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCBP1Q09161 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCBP1Q09161 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCBP1Q09161 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCBP1Q09161 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
NCBP1Q09161 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCBP1Q09161 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCBP1Q09161 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NCBP1Q09161 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCBP1Q09161 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCBP1Q09161 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NCBP1Q09161 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCBP1Q09161 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCBP1Q09161 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCBP1Q09161 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCBP1Q09161 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCBP1Q09161 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NCBP1Q09161 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCBP1Q09161 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCBP1Q09161 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCBP1Q09161 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCBP1Q09161 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCBP1Q09161 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCBP1Q09161 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCBP1Q09161 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCBP1Q09161 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCBP1Q09161 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCBP1Q09161 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms