Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC18A2Q05940 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC18A2Q05940 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC18A2Q05940 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC18A2Q05940 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC18A2Q05940 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC18A2Q05940 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC18A2Q05940 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC18A2Q05940 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC18A2Q05940 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC18A2Q05940 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC18A2Q05940 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC18A2Q05940 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC18A2Q05940 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC18A2Q05940 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC18A2Q05940 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC18A2Q05940 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC18A2Q05940 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC18A2Q05940 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC18A2Q05940 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC18A2Q05940 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC18A2Q05940 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC18A2Q05940 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC18A2Q05940 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC18A2Q05940 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC18A2Q05940 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC18A2Q05940 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC18A2Q05940 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC18A2Q05940 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC18A2Q05940 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC18A2Q05940 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC18A2Q05940 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC18A2Q05940 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC18A2Q05940 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC18A2Q05940 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC18A2Q05940 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC18A2Q05940 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC18A2Q05940 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC18A2Q05940 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC18A2Q05940 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC18A2Q05940 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC18A2Q05940 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC18A2Q05940 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC18A2Q05940 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC18A2Q05940 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC18A2Q05940 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC18A2Q05940 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC18A2Q05940 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC18A2Q05940 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC18A2Q05940 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC18A2Q05940 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC18A2Q05940 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC18A2Q05940 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC18A2Q05940 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC18A2Q05940 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC18A2Q05940 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC18A2Q05940 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC18A2Q05940 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC18A2Q05940 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC18A2Q05940 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC18A2Q05940 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC18A2Q05940 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC18A2Q05940 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC18A2Q05940 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC18A2Q05940 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC18A2Q05940 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC18A2Q05940 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC18A2Q05940 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC18A2Q05940 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC18A2Q05940 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC18A2Q05940 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC18A2Q05940 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC18A2Q05940 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC18A2Q05940 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC18A2Q05940 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC18A2Q05940 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC18A2Q05940 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC18A2Q05940 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC18A2Q05940 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC18A2Q05940 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC18A2Q05940 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC18A2Q05940 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC18A2Q05940 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC18A2Q05940 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC18A2Q05940 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC18A2Q05940 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC18A2Q05940 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC18A2Q05940 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC18A2Q05940 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC18A2Q05940 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC18A2Q05940 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC18A2Q05940 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC18A2Q05940 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC18A2Q05940 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC18A2Q05940 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC18A2Q05940 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC18A2Q05940 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC18A2Q05940 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC18A2Q05940 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC18A2Q05940 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms