Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPN12Q05209 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPN12Q05209 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPN12Q05209 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPN12Q05209 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPN12Q05209 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPN12Q05209 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPN12Q05209 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPN12Q05209 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPN12Q05209 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPN12Q05209 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPN12Q05209 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPN12Q05209 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPN12Q05209 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPN12Q05209 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPN12Q05209 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPN12Q05209 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPN12Q05209 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPN12Q05209 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPN12Q05209 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPN12Q05209 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPN12Q05209 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
PTPN12Q05209 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPN12Q05209 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPN12Q05209 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPN12Q05209 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPN12Q05209 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPN12Q05209 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPN12Q05209 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPN12Q05209 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPN12Q05209 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPN12Q05209 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPN12Q05209 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPN12Q05209 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPN12Q05209 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPN12Q05209 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPN12Q05209 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPN12Q05209 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPN12Q05209 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPN12Q05209 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPN12Q05209 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPN12Q05209 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPN12Q05209 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPN12Q05209 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPN12Q05209 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPN12Q05209 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPN12Q05209 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPN12Q05209 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPN12Q05209 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PTPN12Q05209 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPN12Q05209 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPN12Q05209 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPN12Q05209 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPN12Q05209 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPN12Q05209 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPN12Q05209 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPN12Q05209 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPN12Q05209 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPN12Q05209 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPN12Q05209 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPN12Q05209 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPN12Q05209 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPN12Q05209 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPN12Q05209 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPN12Q05209 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPN12Q05209 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPN12Q05209 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPN12Q05209 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPN12Q05209 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPN12Q05209 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPN12Q05209 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPN12Q05209 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPN12Q05209 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPN12Q05209 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
PTPN12Q05209 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPN12Q05209 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPN12Q05209 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPN12Q05209 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPN12Q05209 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPN12Q05209 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPN12Q05209 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPN12Q05209 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPN12Q05209 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPN12Q05209 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPN12Q05209 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPN12Q05209 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPN12Q05209 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPN12Q05209 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPN12Q05209 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPN12Q05209 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPN12Q05209 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPN12Q05209 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPN12Q05209 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPN12Q05209 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPN12Q05209 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPN12Q05209 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPN12Q05209 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPN12Q05209 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
PTPN12Q05209 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPN12Q05209 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms