Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE3AQ05086 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE3AQ05086 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE3AQ05086 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE3AQ05086 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE3AQ05086 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE3AQ05086 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE3AQ05086 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE3AQ05086 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE3AQ05086 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
UBE3AQ05086 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE3AQ05086 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE3AQ05086 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE3AQ05086 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE3AQ05086 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE3AQ05086 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE3AQ05086 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE3AQ05086 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE3AQ05086 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE3AQ05086 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE3AQ05086 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE3AQ05086 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE3AQ05086 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE3AQ05086 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE3AQ05086 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE3AQ05086 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE3AQ05086 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE3AQ05086 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE3AQ05086 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE3AQ05086 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE3AQ05086 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE3AQ05086 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE3AQ05086 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE3AQ05086 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE3AQ05086 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE3AQ05086 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE3AQ05086 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE3AQ05086 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE3AQ05086 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE3AQ05086 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
UBE3AQ05086 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE3AQ05086 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE3AQ05086 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE3AQ05086 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE3AQ05086 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE3AQ05086 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE3AQ05086 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE3AQ05086 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE3AQ05086 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE3AQ05086 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE3AQ05086 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE3AQ05086 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE3AQ05086 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE3AQ05086 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE3AQ05086 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE3AQ05086 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE3AQ05086 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE3AQ05086 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE3AQ05086 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE3AQ05086 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE3AQ05086 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE3AQ05086 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE3AQ05086 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE3AQ05086 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE3AQ05086 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE3AQ05086 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE3AQ05086 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE3AQ05086 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE3AQ05086 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE3AQ05086 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE3AQ05086 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE3AQ05086 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE3AQ05086 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE3AQ05086 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE3AQ05086 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE3AQ05086 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE3AQ05086 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE3AQ05086 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBE3AQ05086 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBE3AQ05086 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBE3AQ05086 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBE3AQ05086 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBE3AQ05086 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBE3AQ05086 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
UBE3AQ05086 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBE3AQ05086 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBE3AQ05086 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBE3AQ05086 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBE3AQ05086 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBE3AQ05086 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBE3AQ05086 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBE3AQ05086 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBE3AQ05086 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBE3AQ05086 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBE3AQ05086 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBE3AQ05086 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBE3AQ05086 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBE3AQ05086 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBE3AQ05086 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBE3AQ05086 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207.8 ms