Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMX1Q04741 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMX1Q04741 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMX1Q04741 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMX1Q04741 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMX1Q04741 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMX1Q04741 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EMX1Q04741 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMX1Q04741 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMX1Q04741 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EMX1Q04741 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EMX1Q04741 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMX1Q04741 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMX1Q04741 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMX1Q04741 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMX1Q04741 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMX1Q04741 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMX1Q04741 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMX1Q04741 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMX1Q04741 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMX1Q04741 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMX1Q04741 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMX1Q04741 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMX1Q04741 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMX1Q04741 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMX1Q04741 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMX1Q04741 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMX1Q04741 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMX1Q04741 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMX1Q04741 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMX1Q04741 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMX1Q04741 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMX1Q04741 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMX1Q04741 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMX1Q04741 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMX1Q04741 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EMX1Q04741 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMX1Q04741 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMX1Q04741 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMX1Q04741 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMX1Q04741 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMX1Q04741 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMX1Q04741 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMX1Q04741 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EMX1Q04741 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EMX1Q04741 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EMX1Q04741 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EMX1Q04741 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EMX1Q04741 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EMX1Q04741 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EMX1Q04741 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EMX1Q04741 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EMX1Q04741 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMX1Q04741 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMX1Q04741 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMX1Q04741 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMX1Q04741 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMX1Q04741 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMX1Q04741 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EMX1Q04741 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EMX1Q04741 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EMX1Q04741 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EMX1Q04741 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EMX1Q04741 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EMX1Q04741 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EMX1Q04741 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EMX1Q04741 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EMX1Q04741 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EMX1Q04741 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMX1Q04741 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMX1Q04741 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMX1Q04741 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMX1Q04741 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMX1Q04741 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EMX1Q04741 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EMX1Q04741 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EMX1Q04741 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EMX1Q04741 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EMX1Q04741 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMX1Q04741 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMX1Q04741 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMX1Q04741 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMX1Q04741 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMX1Q04741 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMX1Q04741 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMX1Q04741 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMX1Q04741 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMX1Q04741 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMX1Q04741 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EMX1Q04741 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMX1Q04741 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMX1Q04741 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMX1Q04741 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMX1Q04741 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMX1Q04741 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMX1Q04741 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMX1Q04741 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMX1Q04741 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMX1Q04741 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMX1Q04741 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.3 ms