Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSNK2BP67870 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK2BP67870 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK2BP67870 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK2BP67870 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK2BP67870 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK2BP67870 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK2BP67870 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK2BP67870 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK2BP67870 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK2BP67870 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK2BP67870 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK2BP67870 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK2BP67870 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK2BP67870 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK2BP67870 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK2BP67870 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK2BP67870 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK2BP67870 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK2BP67870 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK2BP67870 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK2BP67870 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK2BP67870 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK2BP67870 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK2BP67870 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK2BP67870 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK2BP67870 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK2BP67870 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms