Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMC1P62191 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMC1P62191 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMC1P62191 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMC1P62191 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMC1P62191 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMC1P62191 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMC1P62191 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMC1P62191 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMC1P62191 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMC1P62191 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMC1P62191 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMC1P62191 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMC1P62191 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMC1P62191 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMC1P62191 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSMC1P62191 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PSMC1P62191 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSMC1P62191 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSMC1P62191 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSMC1P62191 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSMC1P62191 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSMC1P62191 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSMC1P62191 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMC1P62191 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMC1P62191 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMC1P62191 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMC1P62191 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSMC1P62191 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSMC1P62191 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSMC1P62191 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMC1P62191 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMC1P62191 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMC1P62191 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMC1P62191 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSMC1P62191 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSMC1P62191 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSMC1P62191 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSMC1P62191 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMC1P62191 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMC1P62191 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSMC1P62191 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PSMC1P62191 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSMC1P62191 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSMC1P62191 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMC1P62191 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMC1P62191 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMC1P62191 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMC1P62191 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMC1P62191 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMC1P62191 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMC1P62191 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMC1P62191 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMC1P62191 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMC1P62191 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMC1P62191 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMC1P62191 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMC1P62191 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSMC1P62191 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSMC1P62191 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSMC1P62191 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSMC1P62191 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSMC1P62191 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSMC1P62191 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSMC1P62191 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms