Protein–RNA interactions for Protein: P61586

RHOA, Transforming protein RhoA, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOAP61586 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOAP61586 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOAP61586 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOAP61586 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOAP61586 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOAP61586 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOAP61586 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOAP61586 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOAP61586 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOAP61586 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOAP61586 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOAP61586 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOAP61586 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOAP61586 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOAP61586 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOAP61586 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOAP61586 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOAP61586 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOAP61586 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOAP61586 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOAP61586 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOAP61586 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOAP61586 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOAP61586 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOAP61586 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOAP61586 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOAP61586 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOAP61586 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOAP61586 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOAP61586 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOAP61586 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOAP61586 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOAP61586 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOAP61586 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOAP61586 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOAP61586 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOAP61586 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOAP61586 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOAP61586 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOAP61586 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOAP61586 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOAP61586 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOAP61586 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOAP61586 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOAP61586 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOAP61586 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOAP61586 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOAP61586 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOAP61586 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOAP61586 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOAP61586 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOAP61586 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOAP61586 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOAP61586 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOAP61586 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOAP61586 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOAP61586 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
RHOAP61586 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOAP61586 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOAP61586 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOAP61586 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHOAP61586 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHOAP61586 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHOAP61586 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHOAP61586 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHOAP61586 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RHOAP61586 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOAP61586 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOAP61586 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOAP61586 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOAP61586 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOAP61586 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOAP61586 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOAP61586 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOAP61586 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOAP61586 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOAP61586 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOAP61586 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOAP61586 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOAP61586 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOAP61586 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOAP61586 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOAP61586 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOAP61586 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOAP61586 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOAP61586 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOAP61586 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOAP61586 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHOAP61586 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RHOAP61586 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHOAP61586 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHOAP61586 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHOAP61586 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHOAP61586 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHOAP61586 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOAP61586 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOAP61586 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOAP61586 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOAP61586 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOAP61586 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms