Protein–RNA interactions for Protein: P60228

EIF3E, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3EP60228 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EIF3EP60228 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EIF3EP60228 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
EIF3EP60228 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EIF3EP60228 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EIF3EP60228 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EIF3EP60228 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EIF3EP60228 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EIF3EP60228 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EIF3EP60228 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EIF3EP60228 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EIF3EP60228 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EIF3EP60228 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EIF3EP60228 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EIF3EP60228 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EIF3EP60228 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EIF3EP60228 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EIF3EP60228 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EIF3EP60228 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
EIF3EP60228 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EIF3EP60228 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EIF3EP60228 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EIF3EP60228 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EIF3EP60228 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EIF3EP60228 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EIF3EP60228 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EIF3EP60228 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF3EP60228 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF3EP60228 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF3EP60228 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF3EP60228 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF3EP60228 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EIF3EP60228 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EIF3EP60228 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EIF3EP60228 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EIF3EP60228 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EIF3EP60228 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EIF3EP60228 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EIF3EP60228 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EIF3EP60228 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EIF3EP60228 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF3EP60228 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF3EP60228 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF3EP60228 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF3EP60228 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
EIF3EP60228 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EIF3EP60228 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EIF3EP60228 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EIF3EP60228 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF3EP60228 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF3EP60228 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF3EP60228 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF3EP60228 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF3EP60228 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF3EP60228 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF3EP60228 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF3EP60228 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF3EP60228 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF3EP60228 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF3EP60228 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF3EP60228 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF3EP60228 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF3EP60228 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF3EP60228 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF3EP60228 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF3EP60228 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF3EP60228 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF3EP60228 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF3EP60228 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF3EP60228 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF3EP60228 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF3EP60228 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF3EP60228 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF3EP60228 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF3EP60228 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF3EP60228 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF3EP60228 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
EIF3EP60228 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF3EP60228 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF3EP60228 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF3EP60228 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF3EP60228 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF3EP60228 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF3EP60228 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF3EP60228 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF3EP60228 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF3EP60228 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF3EP60228 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF3EP60228 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF3EP60228 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF3EP60228 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF3EP60228 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF3EP60228 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF3EP60228 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF3EP60228 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF3EP60228 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF3EP60228 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF3EP60228 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EIF3EP60228 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
EIF3EP60228 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms