Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB38P57729 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB38P57729 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB38P57729 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB38P57729 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB38P57729 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB38P57729 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB38P57729 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB38P57729 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB38P57729 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB38P57729 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB38P57729 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB38P57729 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB38P57729 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB38P57729 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB38P57729 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB38P57729 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB38P57729 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB38P57729 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB38P57729 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB38P57729 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB38P57729 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB38P57729 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB38P57729 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB38P57729 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB38P57729 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB38P57729 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB38P57729 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB38P57729 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB38P57729 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB38P57729 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB38P57729 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB38P57729 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB38P57729 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB38P57729 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB38P57729 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB38P57729 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB38P57729 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB38P57729 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB38P57729 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB38P57729 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB38P57729 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAB38P57729 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB38P57729 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB38P57729 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB38P57729 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB38P57729 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB38P57729 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB38P57729 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB38P57729 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB38P57729 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB38P57729 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB38P57729 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB38P57729 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB38P57729 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB38P57729 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB38P57729 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB38P57729 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB38P57729 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB38P57729 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB38P57729 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB38P57729 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB38P57729 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB38P57729 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB38P57729 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB38P57729 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB38P57729 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB38P57729 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB38P57729 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB38P57729 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB38P57729 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB38P57729 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB38P57729 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB38P57729 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB38P57729 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB38P57729 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB38P57729 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB38P57729 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB38P57729 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB38P57729 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB38P57729 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB38P57729 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB38P57729 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB38P57729 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB38P57729 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB38P57729 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB38P57729 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB38P57729 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB38P57729 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB38P57729 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB38P57729 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB38P57729 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB38P57729 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB38P57729 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB38P57729 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB38P57729 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB38P57729 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB38P57729 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB38P57729 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB38P57729 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms