Protein–RNA interactions for Protein: P55082

MFAP3, Microfibril-associated glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP3P55082 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MFAP3P55082 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MFAP3P55082 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MFAP3P55082 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MFAP3P55082 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MFAP3P55082 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MFAP3P55082 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MFAP3P55082 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MFAP3P55082 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MFAP3P55082 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MFAP3P55082 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MFAP3P55082 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MFAP3P55082 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms