Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPN5P54829 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPN5P54829 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPN5P54829 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN5P54829 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPN5P54829 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN5P54829 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN5P54829 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN5P54829 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN5P54829 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN5P54829 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN5P54829 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN5P54829 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN5P54829 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN5P54829 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN5P54829 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN5P54829 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN5P54829 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN5P54829 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN5P54829 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN5P54829 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN5P54829 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PTPN5P54829 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PTPN5P54829 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN5P54829 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN5P54829 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN5P54829 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN5P54829 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN5P54829 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN5P54829 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN5P54829 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN5P54829 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN5P54829 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN5P54829 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN5P54829 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN5P54829 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN5P54829 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN5P54829 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN5P54829 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN5P54829 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN5P54829 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN5P54829 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN5P54829 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN5P54829 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN5P54829 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN5P54829 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN5P54829 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN5P54829 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN5P54829 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN5P54829 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN5P54829 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN5P54829 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN5P54829 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN5P54829 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN5P54829 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN5P54829 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN5P54829 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN5P54829 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN5P54829 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN5P54829 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN5P54829 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN5P54829 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PTPN5P54829 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN5P54829 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN5P54829 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN5P54829 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN5P54829 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN5P54829 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN5P54829 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN5P54829 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN5P54829 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN5P54829 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN5P54829 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN5P54829 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN5P54829 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN5P54829 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN5P54829 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN5P54829 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN5P54829 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN5P54829 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN5P54829 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN5P54829 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN5P54829 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN5P54829 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN5P54829 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN5P54829 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN5P54829 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN5P54829 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN5P54829 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN5P54829 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN5P54829 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN5P54829 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN5P54829 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN5P54829 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN5P54829 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN5P54829 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN5P54829 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN5P54829 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN5P54829 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN5P54829 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms