Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAP1GDS1P52306 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
RAP1GDS1P52306 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAP1GDS1P52306 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAP1GDS1P52306 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAP1GDS1P52306 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAP1GDS1P52306 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAP1GDS1P52306 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAP1GDS1P52306 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAP1GDS1P52306 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAP1GDS1P52306 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAP1GDS1P52306 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAP1GDS1P52306 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAP1GDS1P52306 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAP1GDS1P52306 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAP1GDS1P52306 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAP1GDS1P52306 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAP1GDS1P52306 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAP1GDS1P52306 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAP1GDS1P52306 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAP1GDS1P52306 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAP1GDS1P52306 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAP1GDS1P52306 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAP1GDS1P52306 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAP1GDS1P52306 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RAP1GDS1P52306 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAP1GDS1P52306 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAP1GDS1P52306 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAP1GDS1P52306 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAP1GDS1P52306 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAP1GDS1P52306 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAP1GDS1P52306 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAP1GDS1P52306 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAP1GDS1P52306 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAP1GDS1P52306 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAP1GDS1P52306 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RAP1GDS1P52306 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAP1GDS1P52306 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAP1GDS1P52306 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAP1GDS1P52306 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAP1GDS1P52306 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAP1GDS1P52306 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAP1GDS1P52306 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAP1GDS1P52306 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAP1GDS1P52306 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAP1GDS1P52306 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAP1GDS1P52306 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAP1GDS1P52306 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAP1GDS1P52306 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAP1GDS1P52306 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAP1GDS1P52306 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAP1GDS1P52306 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RAP1GDS1P52306 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAP1GDS1P52306 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAP1GDS1P52306 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAP1GDS1P52306 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAP1GDS1P52306 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAP1GDS1P52306 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAP1GDS1P52306 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAP1GDS1P52306 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAP1GDS1P52306 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RAP1GDS1P52306 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAP1GDS1P52306 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAP1GDS1P52306 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RAP1GDS1P52306 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAP1GDS1P52306 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAP1GDS1P52306 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAP1GDS1P52306 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAP1GDS1P52306 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAP1GDS1P52306 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAP1GDS1P52306 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAP1GDS1P52306 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAP1GDS1P52306 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAP1GDS1P52306 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAP1GDS1P52306 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAP1GDS1P52306 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAP1GDS1P52306 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAP1GDS1P52306 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAP1GDS1P52306 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAP1GDS1P52306 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAP1GDS1P52306 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAP1GDS1P52306 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAP1GDS1P52306 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAP1GDS1P52306 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAP1GDS1P52306 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAP1GDS1P52306 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAP1GDS1P52306 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAP1GDS1P52306 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAP1GDS1P52306 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms