Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE6CP51160 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE6CP51160 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE6CP51160 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE6CP51160 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE6CP51160 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE6CP51160 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE6CP51160 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE6CP51160 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDE6CP51160 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE6CP51160 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE6CP51160 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE6CP51160 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE6CP51160 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE6CP51160 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE6CP51160 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE6CP51160 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE6CP51160 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE6CP51160 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE6CP51160 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE6CP51160 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE6CP51160 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE6CP51160 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE6CP51160 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE6CP51160 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE6CP51160 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE6CP51160 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE6CP51160 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE6CP51160 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE6CP51160 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE6CP51160 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE6CP51160 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE6CP51160 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE6CP51160 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE6CP51160 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE6CP51160 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE6CP51160 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE6CP51160 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE6CP51160 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE6CP51160 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE6CP51160 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE6CP51160 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE6CP51160 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE6CP51160 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE6CP51160 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE6CP51160 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE6CP51160 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE6CP51160 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE6CP51160 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE6CP51160 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE6CP51160 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE6CP51160 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE6CP51160 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE6CP51160 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE6CP51160 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE6CP51160 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE6CP51160 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE6CP51160 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE6CP51160 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE6CP51160 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PDE6CP51160 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PDE6CP51160 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE6CP51160 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE6CP51160 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE6CP51160 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE6CP51160 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE6CP51160 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE6CP51160 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE6CP51160 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE6CP51160 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE6CP51160 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE6CP51160 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE6CP51160 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE6CP51160 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE6CP51160 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDE6CP51160 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDE6CP51160 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE6CP51160 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE6CP51160 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE6CP51160 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE6CP51160 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE6CP51160 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE6CP51160 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE6CP51160 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE6CP51160 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE6CP51160 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE6CP51160 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE6CP51160 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE6CP51160 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE6CP51160 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE6CP51160 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE6CP51160 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE6CP51160 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE6CP51160 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE6CP51160 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE6CP51160 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE6CP51160 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE6CP51160 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE6CP51160 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE6CP51160 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.7 ms