Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSRP3P50461 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CSRP3P50461 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSRP3P50461 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CSRP3P50461 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSRP3P50461 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CSRP3P50461 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSRP3P50461 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSRP3P50461 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSRP3P50461 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSRP3P50461 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSRP3P50461 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSRP3P50461 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSRP3P50461 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSRP3P50461 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSRP3P50461 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSRP3P50461 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSRP3P50461 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSRP3P50461 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSRP3P50461 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSRP3P50461 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSRP3P50461 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSRP3P50461 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSRP3P50461 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSRP3P50461 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSRP3P50461 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CSRP3P50461 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSRP3P50461 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSRP3P50461 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSRP3P50461 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSRP3P50461 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CSRP3P50461 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSRP3P50461 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSRP3P50461 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSRP3P50461 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSRP3P50461 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSRP3P50461 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSRP3P50461 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSRP3P50461 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSRP3P50461 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSRP3P50461 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSRP3P50461 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSRP3P50461 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSRP3P50461 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSRP3P50461 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSRP3P50461 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSRP3P50461 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSRP3P50461 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSRP3P50461 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSRP3P50461 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSRP3P50461 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSRP3P50461 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSRP3P50461 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSRP3P50461 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSRP3P50461 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSRP3P50461 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSRP3P50461 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSRP3P50461 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSRP3P50461 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CSRP3P50461 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms