Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MTHFRP42898 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MTHFRP42898 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MTHFRP42898 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MTHFRP42898 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MTHFRP42898 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MTHFRP42898 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MTHFRP42898 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MTHFRP42898 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MTHFRP42898 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MTHFRP42898 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MTHFRP42898 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTHFRP42898 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTHFRP42898 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTHFRP42898 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTHFRP42898 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTHFRP42898 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTHFRP42898 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MTHFRP42898 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MTHFRP42898 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MTHFRP42898 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MTHFRP42898 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MTHFRP42898 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MTHFRP42898 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MTHFRP42898 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MTHFRP42898 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTHFRP42898 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTHFRP42898 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTHFRP42898 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTHFRP42898 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MTHFRP42898 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MTHFRP42898 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MTHFRP42898 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MTHFRP42898 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MTHFRP42898 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MTHFRP42898 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MTHFRP42898 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MTHFRP42898 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTHFRP42898 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTHFRP42898 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTHFRP42898 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTHFRP42898 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTHFRP42898 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTHFRP42898 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTHFRP42898 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MTHFRP42898 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTHFRP42898 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTHFRP42898 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTHFRP42898 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MTHFRP42898 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MTHFRP42898 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MTHFRP42898 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MTHFRP42898 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MTHFRP42898 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MTHFRP42898 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MTHFRP42898 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MTHFRP42898 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MTHFRP42898 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MTHFRP42898 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MTHFRP42898 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTHFRP42898 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTHFRP42898 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTHFRP42898 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTHFRP42898 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MTHFRP42898 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MTHFRP42898 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MTHFRP42898 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MTHFRP42898 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MTHFRP42898 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MTHFRP42898 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTHFRP42898 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTHFRP42898 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTHFRP42898 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTHFRP42898 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTHFRP42898 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MTHFRP42898 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTHFRP42898 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTHFRP42898 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTHFRP42898 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MTHFRP42898 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MTHFRP42898 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MTHFRP42898 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MTHFRP42898 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MTHFRP42898 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MTHFRP42898 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MTHFRP42898 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MTHFRP42898 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MTHFRP42898 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MTHFRP42898 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
MTHFRP42898 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MTHFRP42898 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MTHFRP42898 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MTHFRP42898 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MTHFRP42898 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MTHFRP42898 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MTHFRP42898 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MTHFRP42898 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MTHFRP42898 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MTHFRP42898 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MTHFRP42898 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms