Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CTRLP40313 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTRLP40313 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTRLP40313 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTRLP40313 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTRLP40313 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTRLP40313 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTRLP40313 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CTRLP40313 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTRLP40313 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTRLP40313 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTRLP40313 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTRLP40313 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTRLP40313 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTRLP40313 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTRLP40313 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTRLP40313 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTRLP40313 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTRLP40313 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTRLP40313 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTRLP40313 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTRLP40313 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTRLP40313 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTRLP40313 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTRLP40313 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTRLP40313 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTRLP40313 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTRLP40313 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTRLP40313 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTRLP40313 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTRLP40313 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTRLP40313 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTRLP40313 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTRLP40313 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTRLP40313 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTRLP40313 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTRLP40313 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTRLP40313 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTRLP40313 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTRLP40313 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTRLP40313 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTRLP40313 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
CTRLP40313 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CTRLP40313 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTRLP40313 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTRLP40313 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTRLP40313 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CTRLP40313 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTRLP40313 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CTRLP40313 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTRLP40313 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTRLP40313 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTRLP40313 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTRLP40313 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTRLP40313 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTRLP40313 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTRLP40313 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTRLP40313 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTRLP40313 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTRLP40313 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTRLP40313 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTRLP40313 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTRLP40313 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTRLP40313 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTRLP40313 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTRLP40313 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTRLP40313 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTRLP40313 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTRLP40313 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTRLP40313 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTRLP40313 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTRLP40313 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTRLP40313 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTRLP40313 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTRLP40313 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTRLP40313 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTRLP40313 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTRLP40313 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTRLP40313 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTRLP40313 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTRLP40313 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTRLP40313 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTRLP40313 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTRLP40313 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTRLP40313 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTRLP40313 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTRLP40313 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTRLP40313 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTRLP40313 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTRLP40313 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTRLP40313 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTRLP40313 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTRLP40313 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTRLP40313 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTRLP40313 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTRLP40313 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTRLP40313 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTRLP40313 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTRLP40313 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTRLP40313 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms