Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXD12P35452 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD12P35452 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD12P35452 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD12P35452 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD12P35452 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD12P35452 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD12P35452 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD12P35452 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD12P35452 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD12P35452 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD12P35452 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD12P35452 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD12P35452 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD12P35452 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXD12P35452 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXD12P35452 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXD12P35452 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXD12P35452 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD12P35452 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD12P35452 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD12P35452 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD12P35452 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD12P35452 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD12P35452 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXD12P35452 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXD12P35452 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXD12P35452 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXD12P35452 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXD12P35452 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXD12P35452 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXD12P35452 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD12P35452 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD12P35452 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD12P35452 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXD12P35452 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD12P35452 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD12P35452 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD12P35452 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD12P35452 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD12P35452 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD12P35452 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD12P35452 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD12P35452 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD12P35452 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD12P35452 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD12P35452 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD12P35452 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD12P35452 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD12P35452 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD12P35452 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD12P35452 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD12P35452 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD12P35452 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD12P35452 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD12P35452 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD12P35452 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD12P35452 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXD12P35452 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXD12P35452 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXD12P35452 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXD12P35452 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD12P35452 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD12P35452 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms