Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN7P35236 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN7P35236 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN7P35236 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN7P35236 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN7P35236 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN7P35236 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN7P35236 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN7P35236 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN7P35236 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN7P35236 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN7P35236 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN7P35236 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN7P35236 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN7P35236 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN7P35236 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN7P35236 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN7P35236 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN7P35236 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN7P35236 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN7P35236 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN7P35236 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN7P35236 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN7P35236 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN7P35236 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN7P35236 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN7P35236 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN7P35236 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN7P35236 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN7P35236 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN7P35236 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN7P35236 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN7P35236 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN7P35236 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN7P35236 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN7P35236 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN7P35236 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN7P35236 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN7P35236 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN7P35236 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN7P35236 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN7P35236 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN7P35236 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN7P35236 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN7P35236 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN7P35236 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN7P35236 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN7P35236 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN7P35236 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN7P35236 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN7P35236 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN7P35236 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN7P35236 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN7P35236 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN7P35236 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPN7P35236 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN7P35236 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN7P35236 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN7P35236 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN7P35236 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN7P35236 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPN7P35236 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN7P35236 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN7P35236 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN7P35236 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN7P35236 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN7P35236 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN7P35236 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN7P35236 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN7P35236 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN7P35236 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN7P35236 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN7P35236 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN7P35236 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN7P35236 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN7P35236 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN7P35236 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN7P35236 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN7P35236 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN7P35236 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN7P35236 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN7P35236 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN7P35236 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN7P35236 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN7P35236 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN7P35236 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPN7P35236 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN7P35236 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN7P35236 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN7P35236 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN7P35236 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN7P35236 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN7P35236 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN7P35236 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN7P35236 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN7P35236 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN7P35236 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN7P35236 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN7P35236 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN7P35236 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms