Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABRA5P31644 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRA5P31644 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRA5P31644 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRA5P31644 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRA5P31644 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRA5P31644 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRA5P31644 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRA5P31644 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRA5P31644 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA5P31644 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA5P31644 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA5P31644 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA5P31644 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA5P31644 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA5P31644 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA5P31644 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA5P31644 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA5P31644 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA5P31644 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA5P31644 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms