Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASQ1P31415 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASQ1P31415 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASQ1P31415 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASQ1P31415 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CASQ1P31415 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CASQ1P31415 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASQ1P31415 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASQ1P31415 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASQ1P31415 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASQ1P31415 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASQ1P31415 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASQ1P31415 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASQ1P31415 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASQ1P31415 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASQ1P31415 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASQ1P31415 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASQ1P31415 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASQ1P31415 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASQ1P31415 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASQ1P31415 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CASQ1P31415 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASQ1P31415 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASQ1P31415 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASQ1P31415 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASQ1P31415 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASQ1P31415 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASQ1P31415 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASQ1P31415 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASQ1P31415 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASQ1P31415 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASQ1P31415 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASQ1P31415 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CASQ1P31415 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASQ1P31415 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASQ1P31415 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASQ1P31415 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASQ1P31415 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASQ1P31415 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASQ1P31415 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASQ1P31415 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASQ1P31415 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASQ1P31415 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASQ1P31415 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASQ1P31415 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASQ1P31415 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASQ1P31415 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASQ1P31415 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASQ1P31415 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASQ1P31415 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CASQ1P31415 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASQ1P31415 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASQ1P31415 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CASQ1P31415 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASQ1P31415 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASQ1P31415 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASQ1P31415 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASQ1P31415 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASQ1P31415 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASQ1P31415 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASQ1P31415 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASQ1P31415 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASQ1P31415 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASQ1P31415 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASQ1P31415 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASQ1P31415 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASQ1P31415 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CASQ1P31415 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASQ1P31415 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASQ1P31415 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASQ1P31415 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASQ1P31415 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASQ1P31415 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASQ1P31415 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASQ1P31415 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASQ1P31415 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASQ1P31415 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASQ1P31415 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASQ1P31415 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASQ1P31415 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASQ1P31415 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASQ1P31415 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASQ1P31415 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASQ1P31415 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASQ1P31415 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASQ1P31415 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASQ1P31415 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASQ1P31415 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASQ1P31415 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASQ1P31415 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASQ1P31415 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CASQ1P31415 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CASQ1P31415 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CASQ1P31415 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASQ1P31415 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASQ1P31415 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASQ1P31415 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASQ1P31415 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASQ1P31415 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASQ1P31415 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
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