Protein–RNA interactions for Protein: P19623

SRM, Spermidine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRMP19623 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRMP19623 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRMP19623 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRMP19623 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRMP19623 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRMP19623 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRMP19623 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRMP19623 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRMP19623 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRMP19623 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRMP19623 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRMP19623 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SRMP19623 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRMP19623 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRMP19623 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRMP19623 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRMP19623 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRMP19623 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRMP19623 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRMP19623 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRMP19623 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRMP19623 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SRMP19623 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRMP19623 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRMP19623 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRMP19623 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRMP19623 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRMP19623 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRMP19623 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRMP19623 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRMP19623 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRMP19623 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRMP19623 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRMP19623 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRMP19623 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SRMP19623 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SRMP19623 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SRMP19623 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SRMP19623 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SRMP19623 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRMP19623 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRMP19623 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRMP19623 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRMP19623 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRMP19623 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRMP19623 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRMP19623 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRMP19623 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRMP19623 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRMP19623 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRMP19623 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRMP19623 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRMP19623 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRMP19623 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRMP19623 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRMP19623 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRMP19623 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRMP19623 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRMP19623 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRMP19623 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRMP19623 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRMP19623 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRMP19623 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRMP19623 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRMP19623 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRMP19623 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRMP19623 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRMP19623 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRMP19623 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRMP19623 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRMP19623 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRMP19623 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRMP19623 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRMP19623 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRMP19623 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRMP19623 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SRMP19623 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRMP19623 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRMP19623 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRMP19623 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRMP19623 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRMP19623 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRMP19623 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SRMP19623 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRMP19623 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRMP19623 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SRMP19623 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRMP19623 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRMP19623 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRMP19623 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SRMP19623 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRMP19623 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRMP19623 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRMP19623 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRMP19623 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRMP19623 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRMP19623 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SRMP19623 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRMP19623 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRMP19623 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms