Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
VCAM1P19320 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
VCAM1P19320 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
VCAM1P19320 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
VCAM1P19320 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
VCAM1P19320 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
VCAM1P19320 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
VCAM1P19320 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
VCAM1P19320 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
VCAM1P19320 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
VCAM1P19320 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VCAM1P19320 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
VCAM1P19320 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VCAM1P19320 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VCAM1P19320 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VCAM1P19320 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
VCAM1P19320 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VCAM1P19320 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
VCAM1P19320 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
VCAM1P19320 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
VCAM1P19320 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
VCAM1P19320 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
VCAM1P19320 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VCAM1P19320 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VCAM1P19320 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VCAM1P19320 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VCAM1P19320 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VCAM1P19320 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VCAM1P19320 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VCAM1P19320 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VCAM1P19320 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VCAM1P19320 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
VCAM1P19320 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
VCAM1P19320 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VCAM1P19320 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VCAM1P19320 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VCAM1P19320 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VCAM1P19320 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
VCAM1P19320 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VCAM1P19320 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VCAM1P19320 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VCAM1P19320 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VCAM1P19320 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VCAM1P19320 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VCAM1P19320 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VCAM1P19320 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VCAM1P19320 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VCAM1P19320 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VCAM1P19320 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VCAM1P19320 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VCAM1P19320 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VCAM1P19320 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VCAM1P19320 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
VCAM1P19320 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VCAM1P19320 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VCAM1P19320 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VCAM1P19320 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VCAM1P19320 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VCAM1P19320 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VCAM1P19320 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VCAM1P19320 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VCAM1P19320 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
VCAM1P19320 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
VCAM1P19320 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
VCAM1P19320 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
VCAM1P19320 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VCAM1P19320 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
VCAM1P19320 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VCAM1P19320 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
VCAM1P19320 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
VCAM1P19320 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
VCAM1P19320 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
VCAM1P19320 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
VCAM1P19320 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
VCAM1P19320 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VCAM1P19320 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VCAM1P19320 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
VCAM1P19320 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
VCAM1P19320 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VCAM1P19320 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
VCAM1P19320 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VCAM1P19320 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VCAM1P19320 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
VCAM1P19320 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
VCAM1P19320 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VCAM1P19320 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
VCAM1P19320 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
VCAM1P19320 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VCAM1P19320 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
VCAM1P19320 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VCAM1P19320 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
VCAM1P19320 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VCAM1P19320 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VCAM1P19320 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VCAM1P19320 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VCAM1P19320 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VCAM1P19320 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
VCAM1P19320 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VCAM1P19320 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VCAM1P19320 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms