Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFITM1P13164 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFITM1P13164 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFITM1P13164 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IFITM1P13164 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFITM1P13164 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFITM1P13164 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFITM1P13164 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFITM1P13164 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFITM1P13164 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFITM1P13164 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFITM1P13164 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFITM1P13164 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFITM1P13164 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFITM1P13164 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM1P13164 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM1P13164 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM1P13164 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM1P13164 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFITM1P13164 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFITM1P13164 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFITM1P13164 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFITM1P13164 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFITM1P13164 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFITM1P13164 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFITM1P13164 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IFITM1P13164 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFITM1P13164 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms