Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMP4P12644 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP4P12644 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP4P12644 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP4P12644 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP4P12644 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP4P12644 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP4P12644 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP4P12644 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP4P12644 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP4P12644 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP4P12644 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP4P12644 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP4P12644 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP4P12644 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP4P12644 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP4P12644 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP4P12644 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP4P12644 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP4P12644 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BMP4P12644 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BMP4P12644 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BMP4P12644 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BMP4P12644 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BMP4P12644 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BMP4P12644 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BMP4P12644 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BMP4P12644 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BMP4P12644 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BMP4P12644 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BMP4P12644 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BMP4P12644 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BMP4P12644 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BMP4P12644 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BMP4P12644 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BMP4P12644 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BMP4P12644 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BMP4P12644 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BMP4P12644 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BMP4P12644 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BMP4P12644 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BMP4P12644 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BMP4P12644 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BMP4P12644 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BMP4P12644 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BMP4P12644 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BMP4P12644 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BMP4P12644 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BMP4P12644 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BMP4P12644 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BMP4P12644 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BMP4P12644 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BMP4P12644 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BMP4P12644 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BMP4P12644 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BMP4P12644 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BMP4P12644 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BMP4P12644 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BMP4P12644 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BMP4P12644 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BMP4P12644 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BMP4P12644 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BMP4P12644 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BMP4P12644 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BMP4P12644 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BMP4P12644 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BMP4P12644 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BMP4P12644 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BMP4P12644 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BMP4P12644 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BMP4P12644 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BMP4P12644 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BMP4P12644 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BMP4P12644 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BMP4P12644 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BMP4P12644 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BMP4P12644 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BMP4P12644 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BMP4P12644 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BMP4P12644 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BMP4P12644 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BMP4P12644 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BMP4P12644 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BMP4P12644 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BMP4P12644 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BMP4P12644 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BMP4P12644 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BMP4P12644 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BMP4P12644 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BMP4P12644 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BMP4P12644 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BMP4P12644 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BMP4P12644 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BMP4P12644 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BMP4P12644 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BMP4P12644 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BMP4P12644 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BMP4P12644 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP4P12644 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP4P12644 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms