Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VPREB1P12018 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPREB1P12018 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPREB1P12018 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.6 ms