Protein–RNA interactions for Protein: P10253

GAA, Lysosomal alpha-glucosidase, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAAP10253 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GAAP10253 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GAAP10253 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAAP10253 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAAP10253 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAAP10253 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAAP10253 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAAP10253 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GAAP10253 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GAAP10253 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GAAP10253 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GAAP10253 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GAAP10253 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GAAP10253 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAAP10253 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAAP10253 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAAP10253 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAAP10253 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GAAP10253 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GAAP10253 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GAAP10253 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GAAP10253 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GAAP10253 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GAAP10253 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GAAP10253 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GAAP10253 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GAAP10253 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GAAP10253 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAAP10253 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAAP10253 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAAP10253 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAAP10253 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAAP10253 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAAP10253 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAAP10253 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAAP10253 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAAP10253 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAAP10253 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GAAP10253 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAAP10253 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GAAP10253 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAAP10253 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAAP10253 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAAP10253 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAAP10253 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAAP10253 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAAP10253 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GAAP10253 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GAAP10253 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GAAP10253 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GAAP10253 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GAAP10253 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GAAP10253 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAAP10253 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAAP10253 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAAP10253 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAAP10253 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAAP10253 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAAP10253 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAAP10253 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GAAP10253 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GAAP10253 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GAAP10253 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GAAP10253 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GAAP10253 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GAAP10253 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GAAP10253 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GAAP10253 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GAAP10253 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GAAP10253 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GAAP10253 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GAAP10253 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GAAP10253 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GAAP10253 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GAAP10253 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GAAP10253 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GAAP10253 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GAAP10253 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GAAP10253 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GAAP10253 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GAAP10253 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GAAP10253 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GAAP10253 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GAAP10253 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GAAP10253 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GAAP10253 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GAAP10253 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GAAP10253 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GAAP10253 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GAAP10253 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GAAP10253 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GAAP10253 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GAAP10253 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GAAP10253 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GAAP10253 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GAAP10253 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GAAP10253 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GAAP10253 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GAAP10253 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GAAP10253 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms