Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CBSLP0DN79 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CBSLP0DN79 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CBSLP0DN79 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CBSLP0DN79 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CBSLP0DN79 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CBSLP0DN79 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CBSLP0DN79 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBSLP0DN79 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBSLP0DN79 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBSLP0DN79 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBSLP0DN79 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBSLP0DN79 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBSLP0DN79 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBSLP0DN79 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBSLP0DN79 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CBSLP0DN79 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CBSLP0DN79 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CBSLP0DN79 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CBSLP0DN79 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CBSLP0DN79 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CBSLP0DN79 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBSLP0DN79 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CBSLP0DN79 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBSLP0DN79 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBSLP0DN79 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBSLP0DN79 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBSLP0DN79 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBSLP0DN79 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBSLP0DN79 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBSLP0DN79 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBSLP0DN79 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBSLP0DN79 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBSLP0DN79 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBSLP0DN79 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBSLP0DN79 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBSLP0DN79 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBSLP0DN79 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CBSLP0DN79 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBSLP0DN79 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBSLP0DN79 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBSLP0DN79 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBSLP0DN79 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBSLP0DN79 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBSLP0DN79 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBSLP0DN79 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBSLP0DN79 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBSLP0DN79 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CBSLP0DN79 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBSLP0DN79 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBSLP0DN79 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBSLP0DN79 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CBSLP0DN79 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBSLP0DN79 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBSLP0DN79 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBSLP0DN79 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBSLP0DN79 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBSLP0DN79 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBSLP0DN79 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBSLP0DN79 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBSLP0DN79 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBSLP0DN79 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBSLP0DN79 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBSLP0DN79 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms