Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LINC00271P0C7V0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LINC00271P0C7V0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LINC00271P0C7V0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LINC00271P0C7V0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LINC00271P0C7V0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LINC00271P0C7V0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LINC00271P0C7V0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LINC00271P0C7V0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LINC00271P0C7V0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LINC00271P0C7V0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LINC00271P0C7V0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LINC00271P0C7V0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LINC00271P0C7V0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LINC00271P0C7V0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LINC00271P0C7V0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LINC00271P0C7V0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LINC00271P0C7V0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LINC00271P0C7V0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LINC00271P0C7V0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LINC00271P0C7V0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LINC00271P0C7V0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LINC00271P0C7V0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LINC00271P0C7V0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LINC00271P0C7V0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LINC00271P0C7V0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LINC00271P0C7V0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LINC00271P0C7V0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LINC00271P0C7V0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LINC00271P0C7V0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LINC00271P0C7V0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LINC00271P0C7V0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LINC00271P0C7V0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LINC00271P0C7V0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LINC00271P0C7V0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LINC00271P0C7V0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LINC00271P0C7V0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LINC00271P0C7V0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LINC00271P0C7V0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LINC00271P0C7V0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LINC00271P0C7V0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LINC00271P0C7V0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LINC00271P0C7V0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LINC00271P0C7V0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LINC00271P0C7V0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LINC00271P0C7V0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LINC00271P0C7V0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LINC00271P0C7V0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LINC00271P0C7V0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LINC00271P0C7V0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LINC00271P0C7V0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LINC00271P0C7V0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LINC00271P0C7V0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LINC00271P0C7V0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LINC00271P0C7V0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LINC00271P0C7V0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LINC00271P0C7V0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LINC00271P0C7V0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LINC00271P0C7V0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LINC00271P0C7V0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LINC00271P0C7V0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC00271P0C7V0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC00271P0C7V0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC00271P0C7V0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC00271P0C7V0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC00271P0C7V0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LINC00271P0C7V0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LINC00271P0C7V0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LINC00271P0C7V0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LINC00271P0C7V0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LINC00271P0C7V0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LINC00271P0C7V0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LINC00271P0C7V0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LINC00271P0C7V0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LINC00271P0C7V0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LINC00271P0C7V0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LINC00271P0C7V0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LINC00271P0C7V0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LINC00271P0C7V0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LINC00271P0C7V0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LINC00271P0C7V0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LINC00271P0C7V0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LINC00271P0C7V0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LINC00271P0C7V0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LINC00271P0C7V0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LINC00271P0C7V0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LINC00271P0C7V0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LINC00271P0C7V0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LINC00271P0C7V0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LINC00271P0C7V0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LINC00271P0C7V0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LINC00271P0C7V0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LINC00271P0C7V0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LINC00271P0C7V0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LINC00271P0C7V0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LINC00271P0C7V0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LINC00271P0C7V0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LINC00271P0C7V0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LINC00271P0C7V0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LINC00271P0C7V0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms