Protein–RNA interactions for Protein: P08134

RHOC, Rho-related GTP-binding protein RhoC, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOCP08134 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RHOCP08134 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RHOCP08134 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHOCP08134 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHOCP08134 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHOCP08134 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RHOCP08134 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHOCP08134 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHOCP08134 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOCP08134 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOCP08134 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOCP08134 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOCP08134 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOCP08134 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOCP08134 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOCP08134 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHOCP08134 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHOCP08134 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHOCP08134 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHOCP08134 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHOCP08134 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHOCP08134 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHOCP08134 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHOCP08134 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHOCP08134 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHOCP08134 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHOCP08134 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RHOCP08134 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHOCP08134 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHOCP08134 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHOCP08134 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHOCP08134 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHOCP08134 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHOCP08134 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHOCP08134 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHOCP08134 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHOCP08134 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHOCP08134 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHOCP08134 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHOCP08134 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHOCP08134 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHOCP08134 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHOCP08134 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHOCP08134 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHOCP08134 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHOCP08134 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHOCP08134 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHOCP08134 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHOCP08134 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHOCP08134 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHOCP08134 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RHOCP08134 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHOCP08134 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHOCP08134 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHOCP08134 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHOCP08134 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHOCP08134 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHOCP08134 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHOCP08134 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHOCP08134 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHOCP08134 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RHOCP08134 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHOCP08134 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHOCP08134 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHOCP08134 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHOCP08134 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHOCP08134 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHOCP08134 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHOCP08134 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHOCP08134 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RHOCP08134 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHOCP08134 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHOCP08134 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHOCP08134 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHOCP08134 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHOCP08134 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHOCP08134 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHOCP08134 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHOCP08134 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOCP08134 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOCP08134 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOCP08134 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RHOCP08134 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHOCP08134 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHOCP08134 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHOCP08134 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHOCP08134 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHOCP08134 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHOCP08134 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHOCP08134 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHOCP08134 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHOCP08134 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHOCP08134 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHOCP08134 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHOCP08134 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHOCP08134 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHOCP08134 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHOCP08134 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHOCP08134 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHOCP08134 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms