Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NEFMP07197 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NEFMP07197 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NEFMP07197 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NEFMP07197 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NEFMP07197 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NEFMP07197 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NEFMP07197 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NEFMP07197 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NEFMP07197 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NEFMP07197 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
NEFMP07197 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NEFMP07197 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NEFMP07197 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NEFMP07197 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
NEFMP07197 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NEFMP07197 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NEFMP07197 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NEFMP07197 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NEFMP07197 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NEFMP07197 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NEFMP07197 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NEFMP07197 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NEFMP07197 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NEFMP07197 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NEFMP07197 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NEFMP07197 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NEFMP07197 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NEFMP07197 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NEFMP07197 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NEFMP07197 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NEFMP07197 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NEFMP07197 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NEFMP07197 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NEFMP07197 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NEFMP07197 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
NEFMP07197 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NEFMP07197 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NEFMP07197 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NEFMP07197 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NEFMP07197 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NEFMP07197 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NEFMP07197 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NEFMP07197 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NEFMP07197 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NEFMP07197 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NEFMP07197 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NEFMP07197 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NEFMP07197 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NEFMP07197 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NEFMP07197 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
NEFMP07197 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NEFMP07197 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NEFMP07197 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NEFMP07197 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NEFMP07197 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NEFMP07197 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NEFMP07197 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NEFMP07197 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NEFMP07197 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NEFMP07197 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NEFMP07197 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
NEFMP07197 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NEFMP07197 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NEFMP07197 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NEFMP07197 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NEFMP07197 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NEFMP07197 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NEFMP07197 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NEFMP07197 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NEFMP07197 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NEFMP07197 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NEFMP07197 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NEFMP07197 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NEFMP07197 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NEFMP07197 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NEFMP07197 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NEFMP07197 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NEFMP07197 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NEFMP07197 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NEFMP07197 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NEFMP07197 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NEFMP07197 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NEFMP07197 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NEFMP07197 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NEFMP07197 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NEFMP07197 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NEFMP07197 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NEFMP07197 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NEFMP07197 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NEFMP07197 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NEFMP07197 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NEFMP07197 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NEFMP07197 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEFMP07197 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEFMP07197 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEFMP07197 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEFMP07197 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
NEFMP07197 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
NEFMP07197 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms