Protein–RNA interactions for Protein: P04844

RPN2, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN2P04844 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPN2P04844 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPN2P04844 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPN2P04844 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPN2P04844 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPN2P04844 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPN2P04844 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPN2P04844 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPN2P04844 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPN2P04844 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RPN2P04844 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPN2P04844 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPN2P04844 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPN2P04844 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPN2P04844 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPN2P04844 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPN2P04844 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPN2P04844 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPN2P04844 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPN2P04844 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPN2P04844 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPN2P04844 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPN2P04844 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPN2P04844 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPN2P04844 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPN2P04844 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPN2P04844 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPN2P04844 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPN2P04844 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPN2P04844 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPN2P04844 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RPN2P04844 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPN2P04844 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPN2P04844 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPN2P04844 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPN2P04844 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPN2P04844 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPN2P04844 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPN2P04844 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPN2P04844 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPN2P04844 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPN2P04844 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPN2P04844 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPN2P04844 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPN2P04844 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPN2P04844 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPN2P04844 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPN2P04844 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPN2P04844 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPN2P04844 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPN2P04844 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPN2P04844 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPN2P04844 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPN2P04844 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPN2P04844 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPN2P04844 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPN2P04844 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPN2P04844 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPN2P04844 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RPN2P04844 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPN2P04844 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPN2P04844 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPN2P04844 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RPN2P04844 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPN2P04844 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPN2P04844 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RPN2P04844 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPN2P04844 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RPN2P04844 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPN2P04844 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPN2P04844 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPN2P04844 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RPN2P04844 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPN2P04844 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPN2P04844 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPN2P04844 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPN2P04844 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPN2P04844 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPN2P04844 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPN2P04844 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPN2P04844 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPN2P04844 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPN2P04844 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPN2P04844 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPN2P04844 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPN2P04844 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPN2P04844 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPN2P04844 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPN2P04844 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPN2P04844 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPN2P04844 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPN2P04844 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPN2P04844 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPN2P04844 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPN2P04844 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPN2P04844 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPN2P04844 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPN2P04844 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPN2P04844 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPN2P04844 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms