Protein–RNA interactions for Protein: P04049

RAF1, RAF proto-oncogene serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAF1P04049 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAF1P04049 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAF1P04049 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAF1P04049 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAF1P04049 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAF1P04049 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAF1P04049 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAF1P04049 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAF1P04049 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAF1P04049 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAF1P04049 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAF1P04049 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RAF1P04049 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAF1P04049 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAF1P04049 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAF1P04049 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAF1P04049 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAF1P04049 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAF1P04049 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAF1P04049 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAF1P04049 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAF1P04049 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAF1P04049 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAF1P04049 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAF1P04049 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAF1P04049 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAF1P04049 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAF1P04049 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAF1P04049 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAF1P04049 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAF1P04049 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAF1P04049 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAF1P04049 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAF1P04049 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAF1P04049 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAF1P04049 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAF1P04049 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAF1P04049 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAF1P04049 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAF1P04049 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAF1P04049 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAF1P04049 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAF1P04049 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAF1P04049 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAF1P04049 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAF1P04049 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAF1P04049 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAF1P04049 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAF1P04049 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAF1P04049 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAF1P04049 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAF1P04049 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAF1P04049 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAF1P04049 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAF1P04049 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAF1P04049 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAF1P04049 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAF1P04049 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAF1P04049 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAF1P04049 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAF1P04049 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAF1P04049 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAF1P04049 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAF1P04049 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAF1P04049 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAF1P04049 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAF1P04049 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAF1P04049 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAF1P04049 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAF1P04049 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAF1P04049 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAF1P04049 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAF1P04049 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAF1P04049 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAF1P04049 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAF1P04049 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RAF1P04049 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAF1P04049 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAF1P04049 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAF1P04049 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAF1P04049 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAF1P04049 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAF1P04049 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAF1P04049 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAF1P04049 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAF1P04049 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAF1P04049 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAF1P04049 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAF1P04049 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAF1P04049 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAF1P04049 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAF1P04049 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAF1P04049 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAF1P04049 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAF1P04049 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAF1P04049 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAF1P04049 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAF1P04049 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAF1P04049 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAF1P04049 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms