Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-DQB1P01920 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-DQB1P01920 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-DQB1P01920 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-DQB1P01920 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-DQB1P01920 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DQB1P01920 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DQB1P01920 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DQB1P01920 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DQB1P01920 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DQB1P01920 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DQB1P01920 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DQB1P01920 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DQB1P01920 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DQB1P01920 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-DQB1P01920 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-DQB1P01920 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-DQB1P01920 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-DQB1P01920 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-DQB1P01920 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-DQB1P01920 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-DQB1P01920 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-DQB1P01920 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-DQB1P01920 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-DQB1P01920 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-DQB1P01920 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-DQB1P01920 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-DQB1P01920 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-DQB1P01920 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-DQB1P01920 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-DQB1P01920 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-DQB1P01920 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-DQB1P01920 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-DQB1P01920 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-DQB1P01920 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-DQB1P01920 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-DQB1P01920 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-DQB1P01920 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-DQB1P01920 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DQB1P01920 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DQB1P01920 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DQB1P01920 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DQB1P01920 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DQB1P01920 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DQB1P01920 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DQB1P01920 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DQB1P01920 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-DQB1P01920 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DQB1P01920 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DQB1P01920 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DQB1P01920 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DQB1P01920 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DQB1P01920 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DQB1P01920 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DQB1P01920 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DQB1P01920 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DQB1P01920 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DQB1P01920 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-DQB1P01920 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-DQB1P01920 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-DQB1P01920 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-DQB1P01920 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-DQB1P01920 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-DQB1P01920 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-DQB1P01920 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-DQB1P01920 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-DQB1P01920 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-DQB1P01920 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-DQB1P01920 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-DQB1P01920 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-DQB1P01920 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-DQB1P01920 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-DQB1P01920 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-DQB1P01920 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-DQB1P01920 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-DQB1P01920 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-DQB1P01920 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-DQB1P01920 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-DQB1P01920 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-DQB1P01920 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-DQB1P01920 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DQB1P01920 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DQB1P01920 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DQB1P01920 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DQB1P01920 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DQB1P01920 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DQB1P01920 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DQB1P01920 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DQB1P01920 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DQB1P01920 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DQB1P01920 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DQB1P01920 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DQB1P01920 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DQB1P01920 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-DQB1P01920 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-DQB1P01920 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-DQB1P01920 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HLA-DQB1P01920 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HLA-DQB1P01920 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DQB1P01920 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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