Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LCA5LO95447 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LCA5LO95447 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LCA5LO95447 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LCA5LO95447 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LCA5LO95447 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LCA5LO95447 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LCA5LO95447 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LCA5LO95447 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LCA5LO95447 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LCA5LO95447 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LCA5LO95447 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LCA5LO95447 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LCA5LO95447 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LCA5LO95447 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LCA5LO95447 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LCA5LO95447 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LCA5LO95447 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LCA5LO95447 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LCA5LO95447 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LCA5LO95447 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LCA5LO95447 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LCA5LO95447 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LCA5LO95447 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LCA5LO95447 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LCA5LO95447 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LCA5LO95447 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LCA5LO95447 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LCA5LO95447 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LCA5LO95447 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LCA5LO95447 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LCA5LO95447 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LCA5LO95447 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LCA5LO95447 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LCA5LO95447 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LCA5LO95447 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LCA5LO95447 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LCA5LO95447 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LCA5LO95447 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LCA5LO95447 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LCA5LO95447 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LCA5LO95447 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LCA5LO95447 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LCA5LO95447 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LCA5LO95447 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LCA5LO95447 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LCA5LO95447 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LCA5LO95447 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LCA5LO95447 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LCA5LO95447 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LCA5LO95447 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LCA5LO95447 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LCA5LO95447 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LCA5LO95447 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LCA5LO95447 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LCA5LO95447 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LCA5LO95447 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LCA5LO95447 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LCA5LO95447 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LCA5LO95447 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LCA5LO95447 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LCA5LO95447 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LCA5LO95447 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LCA5LO95447 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LCA5LO95447 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LCA5LO95447 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LCA5LO95447 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LCA5LO95447 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LCA5LO95447 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LCA5LO95447 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LCA5LO95447 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LCA5LO95447 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LCA5LO95447 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LCA5LO95447 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LCA5LO95447 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LCA5LO95447 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LCA5LO95447 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LCA5LO95447 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LCA5LO95447 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LCA5LO95447 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LCA5LO95447 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LCA5LO95447 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LCA5LO95447 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LCA5LO95447 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LCA5LO95447 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LCA5LO95447 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LCA5LO95447 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LCA5LO95447 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LCA5LO95447 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LCA5LO95447 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LCA5LO95447 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LCA5LO95447 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LCA5LO95447 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LCA5LO95447 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LCA5LO95447 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LCA5LO95447 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LCA5LO95447 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LCA5LO95447 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LCA5LO95447 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LCA5LO95447 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms