Protein–RNA interactions for Protein: O95178

NDUFB2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB2O95178 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFB2O95178 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFB2O95178 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFB2O95178 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFB2O95178 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFB2O95178 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFB2O95178 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFB2O95178 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFB2O95178 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFB2O95178 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFB2O95178 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDUFB2O95178 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFB2O95178 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFB2O95178 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFB2O95178 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFB2O95178 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFB2O95178 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFB2O95178 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFB2O95178 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFB2O95178 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFB2O95178 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFB2O95178 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFB2O95178 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFB2O95178 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFB2O95178 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFB2O95178 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFB2O95178 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFB2O95178 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFB2O95178 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFB2O95178 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFB2O95178 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFB2O95178 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFB2O95178 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFB2O95178 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFB2O95178 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFB2O95178 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFB2O95178 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFB2O95178 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFB2O95178 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFB2O95178 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFB2O95178 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFB2O95178 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFB2O95178 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFB2O95178 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFB2O95178 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDUFB2O95178 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDUFB2O95178 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFB2O95178 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFB2O95178 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFB2O95178 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFB2O95178 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFB2O95178 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFB2O95178 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFB2O95178 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFB2O95178 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFB2O95178 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFB2O95178 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFB2O95178 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFB2O95178 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFB2O95178 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFB2O95178 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFB2O95178 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFB2O95178 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFB2O95178 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFB2O95178 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFB2O95178 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFB2O95178 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFB2O95178 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFB2O95178 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFB2O95178 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFB2O95178 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFB2O95178 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NDUFB2O95178 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFB2O95178 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFB2O95178 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFB2O95178 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFB2O95178 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFB2O95178 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFB2O95178 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFB2O95178 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFB2O95178 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFB2O95178 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFB2O95178 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFB2O95178 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFB2O95178 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFB2O95178 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFB2O95178 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFB2O95178 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFB2O95178 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFB2O95178 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFB2O95178 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFB2O95178 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFB2O95178 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFB2O95178 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFB2O95178 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFB2O95178 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFB2O95178 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFB2O95178 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFB2O95178 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFB2O95178 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms