Protein–RNA interactions for Protein: O76031

CLPX, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPXO76031 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPXO76031 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPXO76031 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPXO76031 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPXO76031 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPXO76031 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPXO76031 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPXO76031 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPXO76031 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPXO76031 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPXO76031 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLPXO76031 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLPXO76031 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLPXO76031 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLPXO76031 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLPXO76031 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLPXO76031 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLPXO76031 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLPXO76031 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLPXO76031 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLPXO76031 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLPXO76031 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLPXO76031 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLPXO76031 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLPXO76031 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLPXO76031 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPXO76031 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPXO76031 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPXO76031 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLPXO76031 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLPXO76031 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLPXO76031 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLPXO76031 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLPXO76031 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLPXO76031 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLPXO76031 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLPXO76031 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLPXO76031 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLPXO76031 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLPXO76031 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLPXO76031 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLPXO76031 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLPXO76031 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLPXO76031 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLPXO76031 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLPXO76031 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLPXO76031 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPXO76031 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPXO76031 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPXO76031 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPXO76031 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPXO76031 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPXO76031 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLPXO76031 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLPXO76031 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLPXO76031 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLPXO76031 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLPXO76031 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLPXO76031 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLPXO76031 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLPXO76031 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLPXO76031 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPXO76031 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPXO76031 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPXO76031 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPXO76031 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPXO76031 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPXO76031 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPXO76031 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPXO76031 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPXO76031 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPXO76031 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPXO76031 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPXO76031 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPXO76031 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPXO76031 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPXO76031 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPXO76031 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPXO76031 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPXO76031 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPXO76031 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPXO76031 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPXO76031 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPXO76031 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CLPXO76031 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CLPXO76031 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPXO76031 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPXO76031 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPXO76031 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPXO76031 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLPXO76031 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLPXO76031 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLPXO76031 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLPXO76031 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLPXO76031 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLPXO76031 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLPXO76031 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPXO76031 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPXO76031 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPXO76031 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms