Protein–RNA interactions for Protein: O43529

CHST10, Carbohydrate sulfotransferase 10, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST10O43529 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CHST10O43529 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHST10O43529 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHST10O43529 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHST10O43529 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHST10O43529 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHST10O43529 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHST10O43529 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHST10O43529 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHST10O43529 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHST10O43529 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHST10O43529 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHST10O43529 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHST10O43529 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHST10O43529 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHST10O43529 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHST10O43529 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST10O43529 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST10O43529 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST10O43529 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST10O43529 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST10O43529 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST10O43529 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST10O43529 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST10O43529 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST10O43529 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST10O43529 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST10O43529 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHST10O43529 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHST10O43529 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHST10O43529 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHST10O43529 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHST10O43529 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHST10O43529 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHST10O43529 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHST10O43529 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHST10O43529 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHST10O43529 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHST10O43529 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHST10O43529 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHST10O43529 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHST10O43529 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHST10O43529 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHST10O43529 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHST10O43529 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHST10O43529 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHST10O43529 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHST10O43529 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHST10O43529 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHST10O43529 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHST10O43529 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CHST10O43529 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHST10O43529 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHST10O43529 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHST10O43529 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHST10O43529 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHST10O43529 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHST10O43529 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHST10O43529 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHST10O43529 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHST10O43529 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHST10O43529 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
CHST10O43529 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CHST10O43529 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CHST10O43529 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHST10O43529 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHST10O43529 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHST10O43529 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHST10O43529 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHST10O43529 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHST10O43529 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHST10O43529 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHST10O43529 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHST10O43529 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHST10O43529 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHST10O43529 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHST10O43529 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHST10O43529 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CHST10O43529 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHST10O43529 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHST10O43529 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHST10O43529 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHST10O43529 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHST10O43529 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHST10O43529 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHST10O43529 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHST10O43529 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHST10O43529 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHST10O43529 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHST10O43529 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHST10O43529 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHST10O43529 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHST10O43529 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHST10O43529 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHST10O43529 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHST10O43529 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHST10O43529 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHST10O43529 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHST10O43529 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHST10O43529 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms