Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
N4BP3O15049 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
N4BP3O15049 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
N4BP3O15049 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
N4BP3O15049 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
N4BP3O15049 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
N4BP3O15049 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
N4BP3O15049 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
N4BP3O15049 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
N4BP3O15049 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
N4BP3O15049 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
N4BP3O15049 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
N4BP3O15049 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
N4BP3O15049 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
N4BP3O15049 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
N4BP3O15049 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
N4BP3O15049 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
N4BP3O15049 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
N4BP3O15049 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
N4BP3O15049 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
N4BP3O15049 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
N4BP3O15049 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
N4BP3O15049 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
N4BP3O15049 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
N4BP3O15049 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
N4BP3O15049 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
N4BP3O15049 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
N4BP3O15049 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
N4BP3O15049 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
N4BP3O15049 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
N4BP3O15049 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
N4BP3O15049 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
N4BP3O15049 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
N4BP3O15049 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
N4BP3O15049 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
N4BP3O15049 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
N4BP3O15049 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
N4BP3O15049 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
N4BP3O15049 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
N4BP3O15049 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
N4BP3O15049 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
N4BP3O15049 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
N4BP3O15049 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
N4BP3O15049 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
N4BP3O15049 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
N4BP3O15049 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
N4BP3O15049 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
N4BP3O15049 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
N4BP3O15049 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
N4BP3O15049 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
N4BP3O15049 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
N4BP3O15049 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
N4BP3O15049 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
N4BP3O15049 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
N4BP3O15049 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
N4BP3O15049 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
N4BP3O15049 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
N4BP3O15049 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
N4BP3O15049 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
N4BP3O15049 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
N4BP3O15049 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
N4BP3O15049 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
N4BP3O15049 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
N4BP3O15049 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
N4BP3O15049 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
N4BP3O15049 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
N4BP3O15049 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
N4BP3O15049 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
N4BP3O15049 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
N4BP3O15049 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
N4BP3O15049 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
N4BP3O15049 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
N4BP3O15049 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
N4BP3O15049 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
N4BP3O15049 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
N4BP3O15049 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
N4BP3O15049 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
N4BP3O15049 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
N4BP3O15049 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
N4BP3O15049 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
N4BP3O15049 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
N4BP3O15049 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
N4BP3O15049 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
N4BP3O15049 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
N4BP3O15049 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
N4BP3O15049 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
N4BP3O15049 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
N4BP3O15049 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
N4BP3O15049 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
N4BP3O15049 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
N4BP3O15049 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
N4BP3O15049 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
N4BP3O15049 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
N4BP3O15049 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
N4BP3O15049 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
N4BP3O15049 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
N4BP3O15049 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
N4BP3O15049 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
N4BP3O15049 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
N4BP3O15049 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms