Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
CUX2O14529 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC44.36■■■■■ 4.69
CUX2O14529 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
CUX2O14529 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
CUX2O14529 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
CUX2O14529 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
CUX2O14529 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
CUX2O14529 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC44.34■■■■■ 4.69
CUX2O14529 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
CUX2O14529 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
CUX2O14529 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC44.33■■■■■ 4.69
CUX2O14529 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC44.33■■■■■ 4.69
CUX2O14529 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
CUX2O14529 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
CUX2O14529 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC44.3■■■■■ 4.68
CUX2O14529 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC44.3■■■■■ 4.68
CUX2O14529 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC44.29■■■■■ 4.68
CUX2O14529 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC44.29■■■■■ 4.68
CUX2O14529 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.29■■■■■ 4.68
CUX2O14529 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC44.29■■■■■ 4.68
CUX2O14529 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
CUX2O14529 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC44.28■■■■■ 4.68
CUX2O14529 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC44.28■■■■■ 4.68
CUX2O14529 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
CUX2O14529 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
CUX2O14529 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.25■■■■■ 4.67
CUX2O14529 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
CUX2O14529 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC44.24■■■■■ 4.67
CUX2O14529 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC44.24■■■■■ 4.67
CUX2O14529 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
CUX2O14529 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
CUX2O14529 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
CUX2O14529 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC44.22■■■■■ 4.67
CUX2O14529 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
CUX2O14529 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
CUX2O14529 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.21■■■■■ 4.67
CUX2O14529 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
CUX2O14529 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC44.21■■■■■ 4.67
CUX2O14529 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC44.21■■■■■ 4.67
CUX2O14529 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.2■■■■■ 4.67
CUX2O14529 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC44.2■■■■■ 4.67
CUX2O14529 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.67
CUX2O14529 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
CUX2O14529 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
CUX2O14529 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
CUX2O14529 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
CUX2O14529 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
CUX2O14529 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.17■■■■■ 4.66
CUX2O14529 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC44.17■■■■■ 4.66
CUX2O14529 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC44.17■■■■■ 4.66
CUX2O14529 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
CUX2O14529 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC44.17■■■■■ 4.66
CUX2O14529 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
CUX2O14529 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC44.15■■■■■ 4.66
CUX2O14529 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
CUX2O14529 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
CUX2O14529 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.15■■■■■ 4.66
CUX2O14529 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
CUX2O14529 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
CUX2O14529 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
CUX2O14529 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC44.14■■■■■ 4.66
CUX2O14529 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC44.13■■■■■ 4.65
CUX2O14529 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC44.13■■■■■ 4.65
CUX2O14529 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
CUX2O14529 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
CUX2O14529 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
CUX2O14529 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
CUX2O14529 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC44.11■■■■■ 4.65
CUX2O14529 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC44.11■■■■■ 4.65
CUX2O14529 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
CUX2O14529 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC44.1■■■■■ 4.65
CUX2O14529 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
CUX2O14529 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC44.08■■■■■ 4.65
CUX2O14529 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC44.08■■■■■ 4.65
CUX2O14529 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
CUX2O14529 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
CUX2O14529 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
CUX2O14529 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
CUX2O14529 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC44.07■■■■■ 4.65
CUX2O14529 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
CUX2O14529 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.06■■■■■ 4.64
CUX2O14529 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC44.06■■■■■ 4.64
CUX2O14529 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
CUX2O14529 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
CUX2O14529 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC44.04■■■■■ 4.64
CUX2O14529 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC44.03■■■■■ 4.64
CUX2O14529 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
CUX2O14529 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC44.03■■■■■ 4.64
CUX2O14529 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC44.03■■■■■ 4.64
CUX2O14529 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
CUX2O14529 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
CUX2O14529 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44■■■■■ 4.63
CUX2O14529 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC43.99■■■■■ 4.63
CUX2O14529 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
CUX2O14529 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
CUX2O14529 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC43.98■■■■■ 4.63
CUX2O14529 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
CUX2O14529 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
CUX2O14529 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC43.97■■■■■ 4.63
CUX2O14529 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms