Protein–RNA interactions for Protein: O00421

CCRL2, C-C chemokine receptor-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCRL2O00421 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCRL2O00421 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCRL2O00421 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCRL2O00421 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCRL2O00421 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCRL2O00421 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCRL2O00421 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCRL2O00421 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCRL2O00421 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCRL2O00421 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCRL2O00421 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCRL2O00421 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCRL2O00421 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCRL2O00421 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCRL2O00421 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCRL2O00421 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCRL2O00421 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCRL2O00421 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCRL2O00421 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCRL2O00421 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCRL2O00421 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCRL2O00421 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCRL2O00421 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCRL2O00421 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCRL2O00421 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCRL2O00421 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCRL2O00421 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCRL2O00421 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCRL2O00421 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCRL2O00421 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCRL2O00421 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCRL2O00421 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCRL2O00421 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCRL2O00421 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCRL2O00421 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCRL2O00421 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCRL2O00421 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCRL2O00421 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCRL2O00421 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCRL2O00421 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCRL2O00421 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCRL2O00421 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCRL2O00421 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCRL2O00421 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCRL2O00421 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCRL2O00421 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCRL2O00421 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCRL2O00421 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCRL2O00421 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCRL2O00421 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCRL2O00421 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCRL2O00421 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCRL2O00421 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCRL2O00421 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCRL2O00421 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCRL2O00421 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCRL2O00421 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCRL2O00421 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCRL2O00421 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCRL2O00421 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCRL2O00421 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCRL2O00421 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms