Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF4O00268 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF4O00268 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF4O00268 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF4O00268 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF4O00268 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF4O00268 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF4O00268 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF4O00268 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF4O00268 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF4O00268 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF4O00268 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF4O00268 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF4O00268 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF4O00268 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF4O00268 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TAF4O00268 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TAF4O00268 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF4O00268 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF4O00268 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF4O00268 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF4O00268 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF4O00268 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF4O00268 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF4O00268 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF4O00268 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF4O00268 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF4O00268 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF4O00268 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF4O00268 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF4O00268 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF4O00268 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF4O00268 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF4O00268 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF4O00268 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF4O00268 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF4O00268 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF4O00268 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF4O00268 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF4O00268 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF4O00268 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF4O00268 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF4O00268 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF4O00268 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF4O00268 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF4O00268 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF4O00268 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF4O00268 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF4O00268 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF4O00268 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF4O00268 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF4O00268 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF4O00268 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF4O00268 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF4O00268 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF4O00268 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF4O00268 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF4O00268 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF4O00268 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF4O00268 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF4O00268 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF4O00268 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF4O00268 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF4O00268 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF4O00268 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF4O00268 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF4O00268 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF4O00268 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF4O00268 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF4O00268 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF4O00268 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF4O00268 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF4O00268 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF4O00268 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF4O00268 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF4O00268 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF4O00268 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF4O00268 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF4O00268 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF4O00268 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF4O00268 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF4O00268 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF4O00268 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF4O00268 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF4O00268 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF4O00268 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF4O00268 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF4O00268 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF4O00268 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF4O00268 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF4O00268 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF4O00268 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF4O00268 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF4O00268 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF4O00268 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF4O00268 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF4O00268 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF4O00268 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF4O00268 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF4O00268 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms