Protein–RNA interactions for Protein: O00244

ATOX1, Copper transport protein ATOX1, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATOX1O00244 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATOX1O00244 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATOX1O00244 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATOX1O00244 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATOX1O00244 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATOX1O00244 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATOX1O00244 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATOX1O00244 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATOX1O00244 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATOX1O00244 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms