Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARVCFO00192 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARVCFO00192 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARVCFO00192 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARVCFO00192 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARVCFO00192 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARVCFO00192 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARVCFO00192 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARVCFO00192 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARVCFO00192 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARVCFO00192 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ARVCFO00192 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARVCFO00192 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ARVCFO00192 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ARVCFO00192 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARVCFO00192 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARVCFO00192 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ARVCFO00192 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARVCFO00192 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARVCFO00192 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARVCFO00192 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARVCFO00192 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARVCFO00192 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARVCFO00192 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARVCFO00192 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARVCFO00192 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARVCFO00192 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARVCFO00192 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARVCFO00192 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARVCFO00192 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARVCFO00192 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARVCFO00192 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARVCFO00192 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARVCFO00192 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARVCFO00192 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARVCFO00192 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ARVCFO00192 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARVCFO00192 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ARVCFO00192 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARVCFO00192 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARVCFO00192 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARVCFO00192 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARVCFO00192 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARVCFO00192 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARVCFO00192 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARVCFO00192 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARVCFO00192 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARVCFO00192 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARVCFO00192 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARVCFO00192 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARVCFO00192 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARVCFO00192 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARVCFO00192 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ARVCFO00192 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ARVCFO00192 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARVCFO00192 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARVCFO00192 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARVCFO00192 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARVCFO00192 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARVCFO00192 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARVCFO00192 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARVCFO00192 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARVCFO00192 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARVCFO00192 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARVCFO00192 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARVCFO00192 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARVCFO00192 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARVCFO00192 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARVCFO00192 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ARVCFO00192 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARVCFO00192 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARVCFO00192 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARVCFO00192 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARVCFO00192 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARVCFO00192 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARVCFO00192 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARVCFO00192 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARVCFO00192 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ARVCFO00192 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARVCFO00192 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ARVCFO00192 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARVCFO00192 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARVCFO00192 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARVCFO00192 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARVCFO00192 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ARVCFO00192 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARVCFO00192 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARVCFO00192 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARVCFO00192 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARVCFO00192 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARVCFO00192 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARVCFO00192 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARVCFO00192 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARVCFO00192 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARVCFO00192 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARVCFO00192 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARVCFO00192 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARVCFO00192 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARVCFO00192 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARVCFO00192 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms