Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMX2-CTNND1H3BSU7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMX2-CTNND1H3BSU7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMX2-CTNND1H3BSU7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMX2-CTNND1H3BSU7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMX2-CTNND1H3BSU7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMX2-CTNND1H3BSU7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMX2-CTNND1H3BSU7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMX2-CTNND1H3BSU7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMX2-CTNND1H3BSU7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMX2-CTNND1H3BSU7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMX2-CTNND1H3BSU7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMX2-CTNND1H3BSU7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMX2-CTNND1H3BSU7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMX2-CTNND1H3BSU7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMX2-CTNND1H3BSU7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMX2-CTNND1H3BSU7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMX2-CTNND1H3BSU7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMX2-CTNND1H3BSU7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMX2-CTNND1H3BSU7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMX2-CTNND1H3BSU7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMX2-CTNND1H3BSU7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMX2-CTNND1H3BSU7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMX2-CTNND1H3BSU7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMX2-CTNND1H3BSU7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMX2-CTNND1H3BSU7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMX2-CTNND1H3BSU7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMX2-CTNND1H3BSU7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMX2-CTNND1H3BSU7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMX2-CTNND1H3BSU7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMX2-CTNND1H3BSU7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMX2-CTNND1H3BSU7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMX2-CTNND1H3BSU7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMX2-CTNND1H3BSU7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMX2-CTNND1H3BSU7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMX2-CTNND1H3BSU7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMX2-CTNND1H3BSU7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMX2-CTNND1H3BSU7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMX2-CTNND1H3BSU7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMX2-CTNND1H3BSU7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMX2-CTNND1H3BSU7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMX2-CTNND1H3BSU7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMX2-CTNND1H3BSU7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMX2-CTNND1H3BSU7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMX2-CTNND1H3BSU7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMX2-CTNND1H3BSU7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TMX2-CTNND1H3BSU7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMX2-CTNND1H3BSU7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMX2-CTNND1H3BSU7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMX2-CTNND1H3BSU7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMX2-CTNND1H3BSU7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMX2-CTNND1H3BSU7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMX2-CTNND1H3BSU7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMX2-CTNND1H3BSU7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMX2-CTNND1H3BSU7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMX2-CTNND1H3BSU7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMX2-CTNND1H3BSU7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMX2-CTNND1H3BSU7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMX2-CTNND1H3BSU7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX2-CTNND1H3BSU7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX2-CTNND1H3BSU7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX2-CTNND1H3BSU7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX2-CTNND1H3BSU7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX2-CTNND1H3BSU7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMX2-CTNND1H3BSU7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMX2-CTNND1H3BSU7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMX2-CTNND1H3BSU7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMX2-CTNND1H3BSU7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX2-CTNND1H3BSU7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX2-CTNND1H3BSU7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX2-CTNND1H3BSU7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX2-CTNND1H3BSU7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMX2-CTNND1H3BSU7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMX2-CTNND1H3BSU7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMX2-CTNND1H3BSU7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMX2-CTNND1H3BSU7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMX2-CTNND1H3BSU7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX2-CTNND1H3BSU7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX2-CTNND1H3BSU7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX2-CTNND1H3BSU7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX2-CTNND1H3BSU7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMX2-CTNND1H3BSU7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMX2-CTNND1H3BSU7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMX2-CTNND1H3BSU7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms